Origine des virus

Puisque certains ont l'air de s'y connaitre ici ....

Il existe certains gènes capables de se déplacer dans l'adn : les transposons.
Hors certains d'entre eux possèdent des séquences de bases ressemblant à celles des virus.

Faut-il en conclure que les virus seraient des transposons ayant "appris" à quitter l'adn en s'entourant d'une capside ?
Ou alors les transposons sont-ils d'anciens virus qui se sont intégrés dans notre adn et y ont dégénéré, perdant l'aptitude à créer des capsides virales ?

C'est une question assez délicate.Et je ne m'y connais pas beaucoup dessus.Les transposons d'aprés mes souvenirs sont inclus dans des conformations tridimensionelles particulieres et cette conformation découle de la simple séquence primaire de l'adn.Selon une séquence particulière qui fait par exemple une boucle dans l'adn et favoriserait l'excision de celle ci en dehors.C'est comme imaginer la lettre omega majuscule du grec et on prend les ciseaux pour couper la base.

De la à conclure que les virus sont des transposons anciens car il y a similitude de sequence...ca me parait compliqué.Je sais qu'il existe plusieurs types de virus déja,des virus à ARN et à ADN.Et je sais également que la structure des ARN ou ADN sont differentes selon les type de virus.Il y en a qui ont un adn circulaire,d'autre dans le cas ARN sont linéaire.
De plus je me demande si la taille de l'ADN est déja assez longue pour permettre mécaniquement un repliement local de l'adn en forme boucle ou autre structure secondaire.Il faut pas oublier non plus que les virus possédent leur propre panoplie d'enzyme.

Que dire du cas des virus à ARN ? On sait que l'ARN est chimiquement moins stable que l'ADN.Si puis un ADN qui quitte comme ca son environnement (déja il faut le faire pour le quitter,et passer outre les barrieres sub cellulaires) pour devenir un virus,comment expliquer l'apparition de virus à ARN ?

Ou peut etre ma question est mal posé.Car on suppose en fait que la molécule d'ARN est apparue avant l'ADN grace à une découverte en radiocristallographie là ou on montre que le ribosome est dépourvu de proteines (c'était il y a 3 ou 4 ans je ne sais plus).

On en revient un peu à tes questionnements qui ressemble au probleme de l'oeuf et la poule.
Selon la biologie moleculaire on va du flux ARN vers ADN et non l'inverse (sauf chez les retro virus) et c'est a partir de l'ADN que se calque la molecule l'ARN.

Tout ceci n'est qu'hypothèse car on ne sait pas qu'est ce qui est apparu en premier.
Mais on suppose que les virus étaient la bien avant nous.

Certains transposons (les rétrotransposons) ressemblent aux rétro-virus.
Comme eux ils ont des LTR (longues répétitions terminales) à leurs points d'insertion dans l'adn. Comme eux aussi ils contiennent des gènes d'intégrase DDE (permettant de s'inbtégrer dans l'adn) et même de transcriptase inverse.
Ces rétro-transposons semblent être des virus intégrés dans l'adn et qui auraient perdus leurs gènes d'enveloppe.

D'autres transposons (les LINES / rétroposons) possèdent des gènes de transcriptase inverse (comme les rétro-virus) mais pas d'intégrase DDE, ni de séquences LINES. A la place ils possèdent des séquences poly-A tout comme les introns mobiles de classe II (donc ces introns de classe II seraient des rétroposons dégénérés ?).

D'autres transposons (les SINES / rétrons) semblent être des rétroposons dégénérés ayant perdu leurs gènes. Je suppose donc qu'il ont perdu la faculté de se déplacer dans l'ADN (sauf en se servant des enzymes des rétroposons).

D'autres transposons n'ont pas de gènes de transcriptase inverse mais des gènes de transposase et d'intégrase. Parfois leur transposase est de type DDE et ils possèdent des LTR.

13% du génome est composé de SINES.
20% est composé de LINES.
8% serait composé de rétrovirus endogènes (dont les rétrotransposons ?)
3% est composé de transposons.

44% de notre génome serait donc occupé par des éléments soupconnés d'être "étrangers" !

Si on suppose que les virus ont été là avant nous (avant la vie autonome à proprement parler),on peut bien croire que notre génome est remplie de séquences étrangères,et intuitivement ça ne m'étonnerait pas.

On peut toujours imaginer qu'au départ,nous "étions" de simples agencement de molécules d'ARN et qu'ensuite est apparue L'ADN et que la complexification à fait le reste.
Quand aux virus ça seraient des éléments primaires d'existence.Rien qu'en y pensant ça me donne un coup de frisson tout ça.

Je viens justement de lire une revue qui en parle.

On pense maintenant que les 1ers êtres vivants auraient utilisé uniquement de l'ARN.

Ensuite les protéines auraient été "inventées" pour remplacer l'ARN dans certaines fonctions catalytiques.

Les 1ers virus (à ARN) seraient alors apparus, en tant que parasites de ces bactéries à arn et protéines).

Ensuite, pour être plus résistants faces aux défences des bactéries, les virus auraient "inventés" l'ADN (d'abord de l'ADN à uracile puis de l'ADN à thymine).

Certains de ces virus à ADN ayraient alors parasité des bactéries et leurs auraient injecté leur ADN.
C'est ainsi que seraient apparues les bactéeies à ADN.

Il semble d'ailleurs que l'introduction de l'ADN dans les cellules se soit fait deux fois (par deux virus différents). Une fois chez l'ancètre des eubactéries et une fois ches l'ancètres des archéobactéries et des eucaryotes ! cela expliquerait qu'il existe deux types de synthèse enzymatique de l'ADN chez les êtres vivants.

A noter qu'on a découvert récemment un virus géant : le mimivirus, qui possède plus de gènes que les plus petites bactéries.
Peut-être est-il un descendants des anciens virus, à l'époque ou ceux-ci venaient à peine de se séparer des proto-bactéries ?
Ses gènes ressemblent plus à ceux des archéobactéries et eucaryotes que des eubactéries. Donc il est peut-être apparenté aus anciens virus qui ont apporté l'ADN dans les archéobactérie-eubactéries.